日本时任首相菅直人最终决定低调处理此事件

另外，仙谷还承认，菅直人在作出指示后，仙谷本人要求日本法务和检察当局遵从首相放人放船的指示，并派遣外务省官员作为“参考人”前往那霸地方检察厅，亲自详细阐明日外务省的立场。鉴于此，那霸地方检察厅表示“放还中国船长是考虑到对国民的影响以及今后的中日关系”，但菅直人和仙谷由人当时则强调，“此举系检察机关自己作出的决定”。

2010年中日撞船事件发生后，日方在钓鱼岛海域非法抓扣中国渔民渔船，激起了全中国人民的强烈愤慨，也对中日关系造成了严重损害。对此，中国外交部发言人曾多次要求日方采取实际行动，立即无条件放船放人，为消除此事件给中日关系带来的负面影响、修补两国关系作出切实努力。同时，中方希望中日双方共同努力，相向而行，使两国关系回到正确的发展轨道。中日关系能否回到正常发展轨道，关键看日方的态度和行动。

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