《国统纲领》为两岸的交流、交往设定了三个阶段的进程：近程，互惠交流阶段；中程，互信合作阶段；远程，协商统一阶段。

　　苏进强指出，现在两岸的交流仍停留在“交流互惠”的近程阶段。“当时北京之所以没有对《国统纲领》持有一个比较正面的态度，正是因为那时两岸之间仍缺乏互信。李登辉在1999年发表‘特殊的国与国关系’，同样是没有互信的表现。”

　　“假如李登辉时代的《国统纲领》能够延续到现在，两岸已经进入中程阶段了，两岸和平发展也会得到更好地发展，”苏进强说到，“我同大陆的许多智库专家，甚至在职的官员谈论《国统纲领》时，他们大都表示愿乐观其成，《国统纲领》如果恢复，两岸的政治互信就可以累积。”

　　恢复适用《国统纲领》就在马英九的一念之间

　　台湾“国防部”网站刊载台湾国防大学海军指挥参谋学院研究教官吴国中中校文章，对两岸建立军事互信的过程进行了一番梳理：李登辉总统执政时期，1991年台湾单边宣布终止两岸敌对关系，并依《国统纲领》达成统一的三阶段声明。1995年4月台湾“国统会”提出两岸建立交流与互信机制之声明；1997年台湾“中华搜救协会”与大陆海上搜救中心设立非军事热线，执行台湾海峡海上救援。1998年4月“行政院前副院长”萧万长曾公开表示，为避免因误判引发战争，两岸应交换军演资讯，建立军事互信机制。

　　陈水扁亦曾表示，为避免因彼此隔阂导致对军事资讯误解与误判，两岸有必要建立军事互信机制。在2002年台湾“国防”报告书中，呼吁两岸在不拘形式、不预设立场、相互尊重情形下，建立军事互信机制。2004年的“国防”报告书中，军事互信机制的建议，亦延续2002年“国防”报告书的精神。大陆为回应台湾呼吁，曾在2004年5月17日发表《五一七声明》，以及2005年3月的“胡四点”，均声称在“一个中国”原则与摒弃台独主张下，两岸可结束敌对状态，建立军事互信机制。但因陈水扁提出“一边一国”与“公投入宪”等议题，两岸紧张情势再度升高，两岸军事互信机制的建议仅沦为纸上谈兵。

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