到1999年菲律宾打算重新启动军备计划的时候，引进美国援助成为首要选择。菲美达成《访问部队协定》，为美国在菲律宾的军事存在提供了基础。

菲律宾军舰。

　　除了举行5000多人参加的联合军事演习，时任美国总统克林顿承诺为菲律宾提供1亿美元军事援助。同时，美国向菲律宾提供了包括1艘岸防炮艇在内的旧装备。

　　“总统阿基诺三世推进军队现代化的因素，首先是内部叛乱在美国反恐支援下被镇压，现在摩洛伊斯兰解放阵线人数减少了一半以上，‘新人民军’减少了五分之四，菲律宾可以把精力和财力转移到海空军建设上来。”艾伦说。

　　阿基诺三世竞选时提出的国防建设计划是：将菲律宾军费从GDP的1%提高到2%，重点从平定国内叛乱转移到领土防御和救灾的现代化。

　　2010年7月至2011年1月，在阿基诺三世执政的最初几个月里，菲律宾在武装部队现代化上投入的资金接近4亿美元。而在之前的15年中，军费总额不过8亿美元左右。